按照我校内医党发［2004］ 33号文件精神及我校团学工作“十一五”规划要求，学校于2007年1月8日—18日对所属九个二级学院（部）、三所附属医院的团学工作进行了年度评估。
根据学校党委2004年下发的《内蒙古医学院团学工作考评办法》，制定了详细的评估细则，对评估内容进行科学量化，成立了由迟耀君副书记任组长，毅和副院长、赵润梅部长任副组长的评估工作领导小组。评估前又召开了评估工作会议，对评估组成员进行了系统的培训，并提出了评估的具体要求。
本次评估是对团学工作的全面评估。按照听、查、看、问、议、评等程序，进行了评估验收，特别是对团学工作干部进行了对话式考核，效果良好。听取了分管领导对团学工作情况的汇报，查阅了文件、档案及有关材料，按学生总数的5%开展问卷调查，实地查看了团学工作办公条件，并分别召开了师生代表座谈会，听取了他们对团学工作的意见和要求，最后根据评估办法进行了评估和打分。在评估时评估组坚持定量与定性相结合，坚持实事求是、客观
公正的原则。
通过评估发现，各受评单位今年的团学工作较去年有了明显的进步。其中，进步较快的单位有：公共卫生管理学院、二附院、护理学院、公共教育学院；整体工作较扎实的单位有：药学院、研究生学院、基础医学院、一附院；医药应用技术学院、临床医学部、附属人民医院也有一定的进步。有毕业生的部门积极为毕业生就业提供全方位的服务，在拓展毕业生就业渠道等方面也取得了一定的成绩；药学院、中蒙医学院、护理学院初次就业率高于年初目标。
通过评估,也发现我校团学工作仍然存在许多不足:一是个别二级学院（部）领导对学生工作的重要性认识不够，重视不足，还没有把学生工作摆到应有的位置上。有的二级学院分管领导对团学工作的整体思路不太清晰，缺乏有效地指导。二是在团学工作干部队伍建设方面，还存着一些亟待解决的问题。有的单位对团学干部培养、指导不够，有的团学干部业务素质相对较低，工作能力相对较差，有的甚至不能有效地开展日常工作，有的单位的团学干部年龄偏大，团学工作理论研究不够。三是团学工作重点不突出，团的基层组织建设不规范、不扎实，工作中创新力度不够，缺乏品牌活动。四是大学生思想政治教育没有具体措施，学风建设不够深入，未形成教育体系。五是对班主任（专职辅导员）工作缺乏有效的管理和监督，有的单位班主任（专职辅导员）的作用没有得到充分发挥。六是有的单位对大学生科技创新活动重视不够。七是档案工作整体不够规范，不符合本科教学评估要注。
本次评估实绩较突出的单位是：药学院、研究生学院、基础医学院；优秀的单位是：护理学院、公共卫生管理学院、二附院；良好的单位是：一附院、公共教育学院；合格单位是：医药应用技术学院、附属人民医院；基本合格单位是：中蒙医学院、临床医学部。学院决定对评估良好以上的单位将要进行表彰奖励。
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